Sci Rep：5-miRNA标签特征可作为食管鳞状细胞癌的生存率生物标志物

2021-11-15 07:04:56 来源:

这项研究成果旨在确定一种可以计算冠状动脉鳞状细胞癌（ESCC）患者相比较生存率（OS）的miRNAs标签。

从NCBI GEO获得119名ESCC患者的miRNA传达曲谱及其相应的临床信息，并将其作为特训集。在后期和晚期试样间配对差异传达的miRNAs（DEmiRNAs）。使用Cox复出分析、正则传达式特征除去（RFE）-支持向量机（SVM）启发式和LASSO Cox复出模型来辨识HRS性miRNAs，从而建起HRS高分模型。此外，计算了这些HRS性miRNAs的有寄望靶基因，然后构建了miRNA靶基因互联网。通过功能富集分析，分析了ESCC中这些HRS性miRNAs计算靶基因的功能涉及性。

在特训集中，后期与晚期试样有46个DEmiRNAs。建起了基于5个miRNAs的不确定性高分模型。该5-miRNA不确定性高分可以将特训集包含OS时间明显相同的高危组和低危组。在一个来自癌症基因组图曲谱（TCGA）的独立数据集中，成功正确性了5-miRNA不确定性高分的不确定性分层控制能力。已确定了与这些miRNAs涉及的各种免疫学步骤和路中，例如Wnt信号路中、TRP出口处的发炎介质调节路中和甲状腺激素信号路中。

这项研究成果提示，与解剖分期涉及的5-miRNA标签对计算ESCC患者的HRS具有临床意义。

重构出处：

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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