生活在化学物质肠道内的病原体在化学物质的代谢、免疫等层面都展现成着至关重要的起到，病原体失衡则会引致一系列营养不良的发生，比如克罗恩眼疾（CD）和其他形式的炎症性肠眼疾(IBD)等。但这些关联看似的生物学功能仍不清楚。美国耶鲁大学总医院(MGH)贝塔数据分析所(Broad Institute)和耶鲁大学医学院(Harvard Medical School)的数据分析医务人员那时候推断成，一种与克罗恩眼疾相关的、取名活泼家兔杆菌(Ruminococcus gnus)的寄生虫则会释放某种甘油(或蔗糖分子则会多肽)，触发免疫细胞。R.gnus电镜照片该数据分析发表文章在《PNAS》上，是最早揭示肠道生物体与生物营养不良错综复杂关连功能的数据分析之一。“这是一种独特的分子则会，代表了肠道生物体与炎症性营养不良错综复杂的潜在关联，”第一作者Matthew Henke问道。“生物体病原体与营养不良的关连数据分析愈加多，”HMS的生物化学与分子则会医学教授Clardy问道，“有些相关性非常爆冷，但有些要强，但总归都是相关的。”R.gnus与CD相关有约有200万美国人中风炎症性肠眼疾(IBD)，还包括克罗恩眼疾。贝塔核心数据分析所(Broad core institute)新成员、霍乱和生物体组计划联合处长Ramnik Xier的Laboratory年末的明，在克罗恩眼疾的某些爆发期，R.gnus在肠道病原体的核素可以从不足1%跃升至超过50%。Xier，Clardy和Henke就让通过数据分析确切克罗恩眼疾与R.gnus错综复杂的关联，其看似的生物学功能到底是没用？炎症性甘油于是，数据分析团队在Laboratory中都培育成成R.gnus菌落后，对该寄生虫转化成的所有分子则会进行了鉴定，以确切是否普遍存在促炎突变。他们推断成R.gnus多肽并分泌物有着鼠李蔗糖硬壳和后侧多肽的复合甘油。进一步数据分析表明，该甘油主要由三个鼠李蔗糖单元形成的线性硬壳和由两个单元形成的短后侧多肽组成。鼠李蔗糖硬壳由1,2-和1,3-连接的鼠李蔗糖单元制成，后侧多肽有着与1,6-连接的末端。这个甘油能有效地抑制神经纤维脂质炎性细胞突变（TNFα），并且TNFα分泌物具体来问道toll样酶4（TLR4）。揭开硬壳未解后，他们搜索了R.gnus的蛋白质组并鉴定了全权负责制备这种甘油的蛋白质。未来的实验将数据分析这些蛋白质是否在克罗恩眼疾癫痫以前过度解读。深远受到影响Henke问道:“如果我们能一个眼疾人，推断成这种甘油的蛋白质在眼疾情恶化以前就早已解读成来，那就相当有问道服力了，这也并不一定这种甘油是克罗恩眼疾癫痫的状况。”如果这个方法论被证明是正确的，数据分析医务人员可以针对R.gnus生长或其转化成这种炎症性甘油的技能，开发重新用药克罗恩眼疾和类似炎症性营养不良的方法。生物体组的受到影响是广泛应用的，这些推断成对克罗恩眼疾以外的其它营养不良同样有着而设计。“那时候我们早已建立了这种方法，我们可以快速检查其他寄生虫，了解生物体组促进营养不良的看似分子则会功能，”Xier问道。以前的数据分析只是表明化学物质肠道生物体组发生变化与宿主营养不良状态普遍存在关连，但大多有数据分析探求这些关连看似的分子则会功能，这项数据分析是第一个数据分析生物体集合与生物身体健康错综复杂关连看似的分子则会功能的数据分析，也为更进一步的数据分析提供非常有价值的借鉴。许多现代成处：Matthew T. Henke, Douglas J. Kenny, et al. Ruminococcus gnus, a member of the human gut microbiome associated with Crohn’s disease, produces an inflammatory polysaccharide. PNAS. Jun 2019.
